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生信实验记录(part1)--为Jupyter指定虚拟环境的Python解释器


学习笔记,仅供参考,有错必纠

为Jupyter指定虚拟环境的Python解释器

引言

上周开始做生信实验,为了不干扰到电脑原来的环境,就整了个虚拟环境(具体虚拟环境的创建流程请见​​Django从理论到实战(part1)–虚拟环境​​​),配置好实验环境后,不知道怎么在Jupyter Notebook中指定虚拟环境的python解释器,查找资料后(​​为 Jupyter Notebook指定虚拟环境的 Python 解释器​​),解决疑问,写下此篇.

实现步骤

首先,开启我的虚拟环境:

生信实验记录(part1)--为Jupyter指定虚拟环境的Python解释器_虚拟环境

在虚拟环境stagate_env中安装​​ipykernel​​库:

pip install ipykernel

如果下载某个包,非常慢,甚至慢到报错,可以使用镜像下载,比如我经常使用清华镜像:

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple ipykernel

向 jupyter 中添加虚拟环境,命名为python37:

python -m ipykernel install --python37

打开jupyter notebook,可以看到​​New​​下拉菜单中,多了python37.

生信实验记录(part1)--为Jupyter指定虚拟环境的Python解释器_python_02

创建好后,我们就可以开始跑实验了.


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