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文献笔记七十三:植物转录本编码能力评估和功能注释的工具NAMS

文章题目


NAMS webserver: coding potential assessment and functional annotation of plant transcripts


期刊


Briefings in Bioinformatics
2020年


完成单位


Shenzhen Bay Laboratory
The Chinese University of HongKong


NAMS的全称是 Noncoding Assessment of long RNAs in Magnoliophyta Species

评估植物转录本是否具有编码能力

在线版 https://sunlab.cpy.cuhk.edu.hk/NAMS/index.html

但是一次只能上传一条序列

单机版 下载链接 https://sunlab.cpy.cuhk.edu.hk/NAMS/download.html

我试了一下,解压出来就可以用

命令是


文献笔记七十三:植物转录本编码能力评估和功能注释的工具NAMS_数据分析 image.png

./NAMS testdata/TAIR10.ncRNA.fa practice/ outresults

没有找到设置线程的参数,默认好像是使用所有

输出结果

文献笔记七十三:植物转录本编码能力评估和功能注释的工具NAMS_单机版_02

输出结果中都有啥内容还需要仔细看一下

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