势文件
examples→airebo→CH.airebo
完整input文件代码见下文
#用lammps生成无定形碳
units metal
atom_style full
boundary p p p
pair_style airebo 2.5 1 1
# ============= 创造盒子
region block block -20 20 -20 20 -20 20
create_box 1 block
create_atoms 1 random 5000 45287 block
#random类型在指定区域内随机生成原子,5000为生成原子总数,45287为随机数种子,block指定填充原子区域。
# ============= 力场
mass 1 12.0107
pair_coeff * * CH.airebo C
# ============= 能量最小化
thermo 10
minimize 1.0e-4 1.0e-6 100 1000
reset_timestep 0
# =============用nvt给原子一个初始速度
# ============= 反应温度从 10000 K 至 4000 K
# ============= 步长 (0.5 fs)
velocity all create 10000 49284 mom yes rot yes dist gaussian
fix mynvt all nvt temp 10000 4000 0.1
timestep 0.0005
# ============= 输出原子位置每5 ps,输出log信息每0.5 ps
dump dp1 all atom 10000 dump.lammpstrj
thermo 1000
# ============= 每一次运行(50 ps)
run 100000
# ============= 保持温度在4000K
# ============= 第二次运行(250 ps)
fix mynvt all nvt temp 4000 4000 0.1
run 500000
# ============= 降温从4000 K到3000 K
# ============= 第三次运行 (250 ps)
fix mynvt all nvt temp 4000 3000 0.1
run 500000
# ============= 降温从 3000 K 至 300 K
# ============= 第四次运行 (50 ps)
fix mynvt all nvt temp 3000 300 0.1
run 100000
# ============= 保持温度在 300 K
# ============= 每五次运行 (5 ps)
fix mynvt all nvt temp 300 300 0.1
run 10000
# ============= 输出最终状态文件
write_data data.lammps
运行结果
你好,能请问一下为什么我运行出来的文件在ovito里面看好像只有碳原子,没有键