0
点赞
收藏
分享

微信扫一扫

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011

今天将在LOLA11数据集上进行肺叶和肺分割的案例分析,给出部分案例结果,感兴趣的赶紧试一试吧。

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_数据集

LOLA11的主要目标是评估用于胸部CT的最新肺叶分割方法的性能。已经发布了许多用于肺和肺叶分割的算法,但是直接比较它们很困难。通常使用不同的评估方法对不同的数据集评估不同的方法。LOLA11提供了具有不同异常情况的胸部CT扫描数据集,为此已建立了肺叶分割参考标准。通过将所有方法与该相同参考标准进行比较,可以进行公正而有意义的评估。LOLA11网站保持开放状态,鼓励团队提交改进的结果。始终欢迎未参加初始阶段的团队注册并提交结果。这样,LOLA11网站将继续在胸部CT扫描中反映出肺和肺叶分割的最新技术水平。

一、目标任务

在进行胸部CT容积扫描的情况下,任务是分割肺和/或肺叶,即将每个体素标记为六类之一:

·  (0)-肺外

· (10)-左肺,上叶

· (11)-左肺,下叶

· (20)-右肺,上叶

· (21)-右肺,中叶

· (22)-右肺,下叶

    还允许使用三个类来简化标签:

· (0)-肺外

· (1)-左肺

· (2)-右肺

    这两种算法的结果分别发布:

· 自动:扫描是唯一输入

· 半自动:需要一些用户输入。例如,不同的扫描使用不同的手动设置算法参数或使用手动设置的种子点。

二、规则

数据的收集,LOLA11研究的组织以及网站的维护都需要付出巨大的努力。本着合作科学进步的精神,我们致力于维护此站点,作为基准肺和肺叶分割结果的公共存储库。作为回报,我们要求使用此站点的每个人都遵守以下规则。

· 在任何情况下,都不得将下载的数据或从这些数据中获取的任何数据提供给或不重新分配给不属于注册团队的人员。

· 注册团队时输入的所有信息,包括联系人的姓名,所属组织(团队的联系人所服务的机构,组织或公司)以及电子邮件地址都必须完整且正确。换句话说,不允许匿名注册。如果要匿名提交(例如,在将结果提交到需要匿名提交的会议时),请首先联系s.kerkstra@rad.umcn.nl。

· 从本网站下载的数据只能用于准备要在本网站上提交的条目。数据不得在科学研究中用于其他目的,也不得用于训练或开发其他算法,包括但不限于用于商业产品的算法。

· 在此站点上提交的每个结果都必须随附描述系统详细信息的pdf文件。LOLA11组织者保留拒绝评估其说明不符合最低要求的系统的权利。有关所需描述的更多说明在下面给出。

· 如果将本研究中算法的结果用于科学出版物(期刊出版物,会议论文,技术报告,大会和会议的演示文稿),则必须进行适当的引用。在发表有关该研究的期刊论文之前,请引用网站URL http://lola11.com。期刊论文发表后,必须引用该论文。该页面将在那时更新。

· 上传到本网站的结果将在该网站上公开提供。提交结果即表示您授予我们这样做的权限。团队保留对该方法的完全所有权和权利。

· 为了使我们能够维护与LOLA11研究相关的出版物清单,团队需要将(部分地)基于该站点数据的任何出版物通知该站点的维护者。

三、数据

对于本研究,许多胸部CT扫描可供下载。扫描来自各种来源,代表了各种临床上常见的扫描仪和协议。选择这些扫描,使得在大约一半的扫描中,肺和/或肺叶的分割被认为是“容易的”,而在另一半中则被认为是“困难的”。当前的最大切片间距为1.5毫米,其中大多数扫描(各向同性)。为了确保评估的一致性,无法下载数据的参考分割结果,以后也将不再提供参考分割结果。

组织者将案件分为“简单”案件和“困难”案件。容易和困难的定义可以基于存在的异常程度,但是,分割任务的困难并不总是那么容易定义的,例如,尽管肺结核很大,但对于存在严重肺气肿的扫描对于肺分割算法来说通常还是很容易的存在的异常肺组织数量。因此,我们选择根据研讨会的已提交算法的结果来定义简单和困难:通过覆盖所有结果,方法之间几乎没有重叠的区域可以定义为难以分割,其中所有方法都一致的区域易于分割。基于此,对于肺和/或肺叶分割,扫描分为易或难。下载地址:https://www.dropbox.com/sh/wzgqzkifjjl8end/AADHxyrL1IbljZVcxzpumr3ga?dl=0

四、参考标准协议

参考标准是通过手动分割肺和肺叶而产生的。使用一组规则来指示肺段在肺门区域与肺血管和支气管相交的位置。这些交叉点远端的支气管和肺血管树的部分被认为是肺容积的一部分。

右肺:上叶:在右上叶支气管第一次分裂之前立即:在右中叶支气管第一次分裂之前(划分为4/5)下叶:在右下叶支气管分裂之前立即基底节段性支气管(分为7/8/9/10)。请注意,右下叶的顶端或上段支气管(6)将包括在肺容积中。

左肺:上叶:在左上支气管第一次分裂之前立即下支叶/舌状支:在左下叶支气管第一次分裂之前立即分裂(分为4/5)下叶:在将左下叶支气管分割为基底节段性支气管之前(分成7/8/9/10)。请注意,左下叶的顶部或上段支气管(6)将包括在肺容积中。

五、实现方法及分割结果

​​LungLobe肺叶多分割挑战赛​​里面已经分享过实现步骤和代码。在这里直接给出部分LOLA11的肺叶分割结果。

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_数据集_02

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_下载地址_03

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_数据_04

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_数据集_05

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_数据集_06

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_数据集_07

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_下载地址_08

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_数据_09

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_下载地址_10

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_下载地址_11

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_下载地址_12

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_数据集_13

LOLA11——肺叶和肺分割挑战赛2011_下载地址_14


举报

相关推荐

0 条评论