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生信软件 | needleall (多对多序列比对)


EMBOSS下载:

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测试文件下载:

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1. 解压到目录

2. 执行命令​ ./configure​ 生成Makefile文件

3. 执行命令​make​编译成执行文件

4. 测试是否编译成功

EMBOSS软件包下的needleall软件

进入安装目录下的emboss文件夹,将测试输入文件复制到一个目录(这步随意,找到文件即可)

执行命令​./needleall -asequence ../test.fa -bsequence ../test.fa -auto -aformat3 pair -sprotein1 1 -sprotein2 1 -outfile out.aln

生信软件 | needleall (多对多序列比对)_多对多序列比对

5. 收工


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