描述
一个 DNA 序列由 A/C/G/T 四个字母的排列组合组成。 G 和 C 的比例(定义为 GC-Ratio )是序列中 G 和 C 两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的 GC-Ratio 可能是基因的起始点。
给定一个很长的 DNA 序列,以及限定的子串长度 N ,请帮助研究人员在给出的 DNA 序列中从左往右找出 GC-Ratio 最高且长度为 N 的第一个子串。
DNA序列为 ACGT 的子串有: ACG , CG , CGT 等等,但是没有 AGT , CT 等等
数据范围:字符串长度满足 1 \le n \le 1000 \1≤n≤1000 ,输入的字符串只包含 A/C/G/T 字母
输入描述:
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度
输出描述:
找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串
示例1
输入:
ACGT 2
复制输出:
CG
复制说明:
ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个,其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5,CG为1,故输出CG
示例2
输入:
AACTGTGCACGACCTGA 5
复制输出:
GCACG
复制说明:
虽然CGACC的GC-Ratio也是最高,但它是从左往右找到的GC-Ratio最高的第2个子串,所以只能输出GCACG。
#include <algorithm>
#include <iostream>
#include <map>
float calcRation(std::string str, int length)
{
int cgCount = 0;
for(int i = 0 ; i < str.length(); ++i)
{
if(str[i] == 'C' || str[i] == 'G')
{
cgCount++;
}
}
return (float)cgCount / length;
}
void DNASequence(std::string str, int length)
{
std::multimap<float, std::string> ratioMap;
for(int i = 0; i <= str.length()-length; ++i)
{
std::string temp = str.substr(i, length);
float ratio = calcRation(temp, length);
ratioMap.insert(std::make_pair(ratio, temp));
}
auto iter = ratioMap.rbegin(); //map的键会自动排序,拿到最大的key可能有多个,所以下面使用find返回的迭代器,可以保证是最先插入的元素,也就是题目的要求
float key = iter->first;
auto iter2 = ratioMap.find(key);
std::cout << iter2->second << std::endl;
}
int main()
{
std::string str;
getline(std::cin, str);
int length;
std::cin >> length;
DNASequence(str, length);
return 0;
}