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如何查找某个物种的基因组大小

小飞侠熙熙 2022-02-16 阅读 38


今天,一位老师问我一个问题:


猪的基因组大小是多少?


我知道大约是2.5Gb,但是怎么查找呢?

这里介绍一个通用的方法,对于某个物种,如何查看它的基因组大小呢。

1. 百度翻译走起

比如猪的英文,你不知道是什么,查一下:

如何查找某个物种的基因组大小_官网

我们知道了,它的英文名是​​pig​

2,进入NCBI官网

NCBI官网:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

如何查找某个物种的基因组大小_其他_02

3,选择基因组(genome)数据库

如何查找某个物种的基因组大小_官网_03

键入​​pig​​,查询

4. 查看pig的界面

猪的基因组大小为:2458.64Mb

如何查找某个物种的基因组大小_数据分析_04

5. 试试猫的基因组大小

基因组大小:2493.14Mb

如何查找某个物种的基因组大小_其他_05

6. 试试狗的基因组

基因组大小:2344.09Mb

如何查找某个物种的基因组大小_其他_06

7. 试试玉米水稻的

玉米基因组大小:2192.4Mb

如何查找某个物种的基因组大小_r语言_07

水稻基因组大小:386.486Mb

如何查找某个物种的基因组大小_数据分析_08

8. 具体信息解读

8.1 第一部分:介绍

如何查找某个物种的基因组大小_r语言_09


谱系:真核生物[8697];后生动物[4225];脊索动物[2098];头盖骨[2075];脊椎动物[2075];真肠造口术[2058];哺乳动物[637];尤瑟里亚[463];Laurasiatheria[263];偶蹄目[127];Suina[3];蝇科[2];Sus[1];Sus scrofa[1]
猪(Sus scrofa)是偶蹄目动物或偶蹄哺乳动物的一员,偶蹄目哺乳动物是一个进化分支,不同于灵长类和啮齿动物。猪存在于具有不同表型和核型的野生和驯化群体中。驯化猪的单倍体基因组估计为2800 Mb。二倍体基因组由18对常染色体和两条性染色体组成。由于其与人类的相似性,它是健康研究的重要模式生物。猪是杂食性动物,其消化生理学与人类相似。人和猪在肾功能、血管结构和呼吸频率方面也存在相似之处。猪在许多医学研究领域被用作模型生物,包括肥胖、心血管疾病、内分泌、酒精中毒、糖尿病、肾病和器官移植。猪在农业上也很重要,因为猪肉是全世界蛋白质的主要来源


8.2 基因组大小,GC含量等

如何查找某个物种的基因组大小_数据分析_10

8.3 每个染色体的大小和长度

如何查找某个物种的基因组大小_官网_11

8.4 染色体图

如何查找某个物种的基因组大小_官网_12

好了,教程写完了。

现学现卖系列。





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