0
点赞
收藏
分享

微信扫一扫

可能会用到的R语言包~5

不会弹吉他的二郎腿 2022-03-12 阅读 51

1 ggpmisc


添加回归曲线


2 ComplexUpset


维恩图


3 colorfindr


提取图片中的配色


4 flextable


统计模型快速出表格 参考微信公众号文章《秒速收藏!一行代码出简洁又美丽的回归表格~》
​​​​https://davidgohel.github.io/flextable/index.html​​​​


5 matrixStats


医学统计与R语言:matrixStats软件包—对行列统计


6 rio


读取excel数据,导出excel数据 公众号推文 《R读取excel文件的最佳方式》


7 furrr


多线程运算R包


8 ggnetwork


网络图
​​​​https://cran.r-project.org/web/packages/ggnetwork/vignettes/ggnetwork.html​​​​


9 SNPfiltR


处理vcf文件中的snp数据
​​​​https://cran.r-project.org/web/packages/SNPfiltR/vignettes/reproducible-vignette.html​​​​


10 fastqcr


检查测序文件的质量 ​​https://github.com/kassambara/fastqcr​​


11 learnr


​​https://pkgs.rstudio.com/learnr/index.html​​ 交互式学习R


12 lindia


github主页 ​​https://github.com/yeukyul/lindia​​


13 tayloRswift


ggplot2配色包 用到的颜色是泰勒斯威夫特专辑的封面配色 ​​https://github.com/asteves/tayloRswift​​


14 ggside


​​​​https://cran.r-project.org/web/packages/ggside/vignettes/ggside_basic_usage.html​​​​ 在图边上加图


15 eulerr


按照实际比例话韦恩图 ​​https://cran.r-project.org/web/packages/eulerr/vignettes/introduction.html​​


16 janitor


Simple Tools for Examining and Cleaning Dirty Data 这里有一个函数是clean_name()用来修改列名中的特殊字符


17 postcards


Create Beautiful, Simple Personal Websites


18、ggside


在ggplot2作图的边上继续添加图片


19、sjmisc


这个包里有一个函数​​rotate_df()​​转置数据框


20、scWGCNA


​​https://github.com/CFeregrino/scWGCNA​​ 单细胞数据共表达网络分析


21、gtsummary


可以把回归分析的结果直接整理成表格 github主页 ​​https://github.com/ddsjoberg/gtsummary​​


22、distill


R语言里构建网站 ​​https://distillery.rbind.io/​​


23、ghibli


​​https://github.com/ewenme/ghibli​​ 吉普力工作室动画配色R包


24、wesanderson


​​​​https://github.com/karthik/wesanderson​​​​ R语言作图配色包 好像都是老电影的配色
​​​​https://moviesincolor.com/​​​​


25、prismatic


​​https://emilhvitfeldt.github.io/prismatic/index.html​​ 也是关于颜色的


26、ggquiver


​​https://pkg.mitchelloharawild.com/ggquiver/reference/geom_quiver.html​​ 一次性画很多个箭头


27、mmtable2


​​https://github.com/ianmoran11/mmtable2​​


28、MLDataR


机器学习数据R包 ​​https://github.com/StatsGary/MLDataR​​ 主要是医学相关的数据


29、ngsReports


​​https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ngsReports/inst/doc/ngsReportsIntroduction.html​​


30、Rfastp


R语言里使用fastp处理fastq数据 ​​http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/Rfastp/inst/doc/Rfastp.html​​


小明的数据分析笔记本


小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子;2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记;3、生物信息学入门学习资料及自己的学习笔记!


举报

相关推荐

0 条评论